2018年3月，喀什职业技术学院开始筹备组建，其以地区中等职业学校为依托，对喀什地区的职业教育办学资源进行了整合优化，涉及喀什地区中等职业学校、喀什卫生学校、喀什师范学校、喀什财贸学校、喀什水利水电学校和喀什艺术学校。
同年10月23日，喀什职业技术学院经新疆维吾尔自治区人民政府批复正式成立。
2019年5月，学校成功在中华人民共和国教育部完成备案；同年9月，迎来首批高职专业学生入学。
历任校(院)长：
乃比江·亚生 现任喀什职业技术学院院长